La Academia Nacional de Ciencias de Bolivia (ANCB) es una organización pública descentralizada que goza de personería jurídica, gestión administrativa autónoma y patrimonio propio. La ANCB está bajo tuición del Ministerio de Educación y Culturas y depende financieramente del Tesoro General de la Nación.
El presupuesto anual otorgado por el Tesoro General de la Nación a la ANCB cubre la partida de ‘Servicios Personales y Previsión Social’ del personal administrativo, y las partidas de ‘Servicios Básicos’ y de ‘Materiales y Suministros’ de la Institución. Debido a que la ANCB es un voluntariado, los Miembros Académicos sólo perciben Dietas por su asistencia a las Asambleas Plenas y a las Sesiones de Directorio.
Sin embargo, la Academia realiza proyectos eventuales de investigación y de otra naturaleza, de acuerdo a su misión y objetivos, que son financiados específicamente en cada caso por instituciones auspiciantes o contratantes privadas o públicas nacionales o extranjeras, o por organismos regionales, internacionales, etc.